نقل از کتاب نام ها و نشانه ها، محمدعلی شاهین
در طومار شیخ بهایی نامی از آن وجود ندارد ولی استاد هنر فر آنرا از آبادیهای بلوک هفتم آورده است که نشان از تاسیس آن بعد از دوران صفویه دارد. در واقع زمین های این منطقه کشاورزی بوده و مالک عمده داشته است. در اینگونه موارد مالک برای کشاورزان شاغل در زمین ها قلعه ای می ساخته و خانه ها درون آن ساخته می شده است. املاک منطقه متعلق به حاج ملك، تاجر دوران نادر بوده که 59 حبه از 72 حبه آن را به نام پسرش جعفر وقف می کند. راه مال روی سده به اصفهان از حوالی این قلعه می گذشته است.
موقعیت جغرافیایی
قلعه در انتهای خیابان شمش و در حوزه شهرداری منطقه 3 خمینی شهر واقع شده است. این منطقه در شرق خمینی شهر در شمال بلوار شهید اشرفی و جنوب بلوار پروفسور میردامادی و شرق زمین های محله خوزان قرار دارد
با مهاجرت ساکنین بختیاری روستاهای پشت سد زاینده رود از دهه 1350 به این منطقه و ساخت خانه در املاک کشاورزی آن، قلعه در بافت جوی آباد جدید قرار گرفت.
گزارشی از جوی آباد، نشریه پیام انقلاب سپاه پاسداران خمینی شهر 1359.
شهر و شهروند، ماهنامه شهرداری خمینی شهر، شماره14، تیر 1385.تقسیم به چهار ناحیه
ریشه نام
نام آن از نام جعفر فرزند مالک عمده زمین های منطقه گرفته شده است.
مناطقی هم در لنجان، خور و بیابانک، تیران و کرون و فارس به نام جعفرآباد وجود دارد.