اداره محیط زیست شهرستان خمینی شهر فعالیت خود را در تاریخ 25 دی 1389 شروع کرد. مراسم افتتاح اداره مزبور با حضور مسؤولین وقت استان و شهرستان در محل سالن اجتماعات شرکت آب و فاضلاب در ابتدای خیابان امیر کبیر برگزار شد. ضرورت های راه اندازی این اداره در شهرستان پرجمعیت بودن و پرتراکم بودن شهرستان بعد از تهران و همجواری با شهر اصفهان اعلام شد. هجوم  واحدهای صنعتی و کارگاهی آلاینده از اصفهان به مناطق مرزی خمینی شهر و نیز تعدد و پراکندگی منابع آلایندگی در شهرستان از دلایل دیگرنیاز شهرستان به اداره محیط زیست مطرح گردید.
دفتر شهرستان خمینی‌شهر به عنوان پنجمین اداره استان کار خود را  در مجاورت اداره آب شروع کرد.
فرماندار وقت: صالحي
نماینده وقت :سید محمد جواد ابطحی
مدیر کل وقت محیط زیست استان، لاهیجان‌زاده