در‏محکمه(درب محکمه) را می‏توان بزرگترین و قدیمی‏ترین جایگاه استقرار حکیمان شهر دانست که حداقل 200 سال پذیرای بیماران منطقه ماربین بوده است. کوچه حکیم‏ ها در دوشنبه بازار منطفه دیگری است که تعدادی از حکیمان در آن مطب و خانه داشتند. تیمچه حاج میرزا به عنوان یک مجتمع درمانی، تجاری در این منطقه ساخته شد.
با تاسیس بلدیه سده، صحیه آن هم دایر شد و مدتی مسوولیت بهداشت و درمان مردم را بر عهده داشت.
تقریبا همزمان با تلاش‏ها برای ساخت بیمارستان ملی در اصفهان در سده عده ‏ای از جمله آیت ‏اله سید ابوالحسن سیادت به فکر تاسیس مریضخانه در شهر خود بودند. در سال ۱۳22 ساختمان نیمه‏ساز بیمارستان به شهرداری واگذار ‏گردید و شهرداری با کمک‏های مردمی و بودجه خود آنرا کمی بعد به بهره برداری رساند
در سال 1326 اداره بهداری در سده تاسیس و چند اطاق مریضخانه سده را برای ایجاد اداره و بهداری اجاره نمود.
در اواخر دهه 1340 زایشگاه شیر و خورشید ساعی آماده بهره برداری شد. اورژانس شهر از حدود سال 1357 در درمانگاه تامین اجتماعی واقع در خیابان بوعلی راه اندازی شد. در سال 1349 ساختمان بیمارستان همایون‏شهر تخریب شد ولی ساخت بیمارستان جدید حدود 15 سال طول کشید و در نهایت اوایل سال 1364 ساختمان آماده و تجهیز و بهره برداری شد.
درمانگاه خیریه ولی‏عصر(عج در سال 1371 در خانه‏ای در خیابان امام شمالی دایر شد.
در سال 1375 ساخت مرکز دیالیز در ضلع شمالی حیاط بیمارستان ساعی شروع گردید و در سال 1377 شروع به کار کرد. در مهر 1394، مرکز ثابت اهداء خون شهرستان خمینی ‎شهر در چهار طبقه شروع به کار کرد.
ساخت بیمارستان 9دی منظریه 24 سال طول کشید و در نهایت در روز دوشنبه 20 شهریور 1396 پذیرش بیمار در آن شروع شد.
در اوایل دهه 1370 گام‏های اولیه برای تاسیس یک مرکز خیریه تحقیقاتی و در‏مانی برداشته شدو بخش‏های رادیولوژی، آزمایشگاه و دیابت آن در تاریخ 30 اردیبهشت 1394 راه اندازی گردید.
در ابتدای دهه 1390 اولین گام ‏های اولیه برای ساخت یک بیمارستان جدید توسط خیرین به جای زایشگاه ساعی برداشته شد.