برحی آثار و تالیفات دکتر مرتضی نورایی:

- اسناد كارگزاري بوشهر، مركز مطالعات تاريخ معاصر ايران، تهران 1385

- نقش كارگزاري هاي داخلي وزارت امورخارجه در روابط ايران و بريتانيا، مركز اسناد و تاريخ ديپلماسي، تهران 1386

- روش پژوهش در تاريخ ،پزوهشگاه فرهنگ وا نديشه اسلامي، تهران 1387(مشترك)

- راهنماي نگارش در تاريخ، جهاد دانشگاهي مشهد، مشهد 1387

- تاريخ آموزي و تاريخ نگاري، پژوهشكده تاريخ اسلام، تهران 1389

- تاریخ‌نگاری محلی و خط نویسی در مصر دوره اسلامی (قرن سوم تا دهم هجری / نهم تا شانزدهم میلادی)

- قباله کارگزاری اصفهان ۱۳۳۴ - ۱۳۲۷ه.ق مجموعه اسناد حقوقی

- نقش کارگزاری‌های داخلی وزارت امور خارجه در روابط ایران و بریتانیا (۱۹۲۸ - ۱۸۹۰/ ۱۳۴۶ - ۱۳۰۸ق.)